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YRAIMA CORDEIRO

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS

CONTATO

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O Laboratório de Biologia Molecular Estrutural – LaBiME – da Faculdade de Farmácia da UFRJ coordenado pela Profa. Yraima Cordeiro está voltado à caracterização estrutural e molecular de proteínas e macromoléculas que sejam potenciais alvos terapêuticos.

 

Dentre os alvos terapêuticos estamos especialmente interessados na caracterização de proteínas envolvidas em amiloidoses e doenças degenerativas. A partir do conhecimento da estrutura e função destas proteínas, objetivamos compreender os mecanismos que levam a sua agregação ordenada e estamos envolvidos na seleção e planejamento de fármacos que atuem sobre os alvos terapêuticos estudados.

As metodologias utilizadas envolvem técnicas espectroscópicas, como fluorescência, dicroísmo circular, espalhamento de luz estático e dinâmico, infravermelho e também metodologias de ponta em biologia molecular estrutural, como espalhamento de raios-X a baixo ângulo.

 

Técnicas de biologia celular são também empregadas para avaliação da toxicidade de agregados proteicos sobre células em cultura e do efeito de compostos selecionados como possíveis agentes terapêuticos. Nosso objetivo é correlacionar estrutura e função de proteínas, assim como compreender suas interações com parceiros moleculares, bem como métodos de intervenção terapêuticos.

 

Publicações selecionadas

 

O grupo de pesquisa inclui uma Pós-doutoranda, uma técnica, alunos de pós-graduação e graduação.

YRAIMA CORDEIRO

YRAIMA CORDEIRO

Coordenadora  LaBiME

Yraima Cordeiro é Doutora em Química Biológica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2005).

 

Seus principais tópicos de pesquisa são enovelamento correto e incorreto e agregação de proteínas envolvidas em doenças degenerativas, com foco na proteína prion. A seleção e avaliação de compostos para a terapia das doenças por prions também são temas de pesquisa em seu laboratório.

 

Yraima Cordeiro é Professora Adjunta da Faculdade de Farmácia, e coordena o Laboratório de Biologia Molecular Estrutural (LaBiME) desde 2009.

 

Seu grupo de pesquisa inclui uma Pós-doutoranda, uma técnica, alunos de pós-graduação e graduação.

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS

1. CORDEIRO, Y.; Macedo, Bruno; Silva, Jerson, L.; Gomes, M. P. B. Pathological implications of nucleic acid interactions with proteins associated with neurodegenerative diseases. Biophysical Reviews, 6, 97-110, 2014. (Veja aqui)

 

2. Ferreira, N. C.; Marques, I.; Da Conceição, W. J. A.; Macedo, Bruno; Machado, C. S.; Mascarello, A.; CHIARADIA-DELATORRE, L. D.; Yunes, R. A.; Nunes, R. J.; HUGHSON, A. G.; RAYMOND, L. D.; PASCUTTI, P. G.; CAUGHEY, B.; CORDEIRO, Y. Anti-Prion Activity of a Panel of Aromatic Chemical Compounds: In Vitro and In Silico Approaches. Plos One, 9, e84531, 2014. (Veja aqui)

 

3. Gonçalves, K. M.; BARBOSA, L. R. S.; Lima, L. M. T. R.; Cortines, J. R.; Kalume, D. E.; Leal, I. C. R.; Miranda, L. S. M.; Souza, R. O. M. A.; Cordeiro, Yraima. Conformational dissection of Thermomyces lanuginosus lipase in solution. Biophysical Chemistry, 185, 88-97, 2014. (Veja aqui)

 

4. Chaves, J.A.P.; SANCHEZ-LOPEZ, C.; Gomes, M. P. B.; SISNANDE, T.; Macedo, B.; End de Oliveira, V.; Braga, Carolina A. C. A.; Rangel, Luciana P.; Silva, Jerson, L.; QUINTANAR, L.; Cordeiro, Yraima. Biophysical and morphological studies on the dual interaction of non-octarepeat prion protein peptides with copper and nucleic acids. Journal of Biological Inorganic Chemistry, 19, 839-851, 2014. (Veja aqui)

 

5. Vieira, T. C. R. G.; Cordeiro, Yraima.; CAUGHEY, B.; Silva, Jerson, L. Heparin binding confers prion stability and impairs its aggregation. The FASEB Journal, 28, 2667-2676, 2014. (Veja aqui)

 

6. Cordeiro, Yraima; Foguel, D.; Silva, J. L. Pressure-Temperature Folding Landscape in Proteins Involved in Neurodegenerative Diseases and Cancer. Biophysical Chemistry, 183, 9-18, 2013. (Veja aqui)

 

7. Silva, Jerson, L.; Rangel, Luciana P.; Ferraz, D.; Cordeiro, Yraima; De Moura-Gallo, Claudia V. Expanding the prion concept to cancer biology: dominant-negative effect of aggregates of mutant p53 tumour suppressor. Bioscience Reports, 33, 593-603, 2013. (Veja aqui)

 

8. de Oliveira, G. A. P.; PEREIRA, E. G.; FERRETTI, G. D. S.; Valente, A. P.; Cordeiro, Y.; Silva, J. L. Intramolecular dynamics within the N-Cap-SH3-SH2 regulatory unit of the c-Abl tyrosine kinase reveal targeting to the cellular membrane. The Journal of Biological Chemistry, 288, 28331-28345, 2013. (Veja aqui)

 

9. Gomes, Mariana P. B.; Vieira, Tuane C. R. G.; Cordeiro, Yraima; Silva, Jerson L. The role of RNA in mammalian prion protein conversion. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA, 3, 415-428, 2012. (Veja aqui)

 

10. Linden, R.; CORDEIRO, Y.; Lima, L. M. T. R. Allosteric function and dysfunction of the prion protein. Cellular and Molecular Life Sciences, 69, 1105-1124, 2012. (Veja aqui)

 

11. Macedo, Bruno; Millen, Thiago A.; Braga, Carolina A. C. A.; Gomes, Mariana P. B.; Ferreira, Priscila S.; Kraineva, Julia; Winter, Roland; Silva, Jerson Lima; Cordeiro, Yraima. Non-Specific Prion Protein-Nucleic Acid Interactions Lead to Different Aggregates and Cytotoxic Species. Biochemistry, 51, 5402-5413, 2012. (Veja aqui)

 

12. Ano Bom, A. P. D.; Rangel, L. P.; Costa, D. C. F.; de Oliveira, G. A. P.; Sanches, D.; Braga, C. A.; Gava, L. M.; Ramos, C. H. I.; Cepeda, A. O. T.; Stumbo, A. C.; De Moura Gallo, C. V.; Cordeiro, Y.; Silva, J. L. Mutant p53 aggregates into prion-like amyloid oligomers and fibrils: Implications for cancer. The Journal of Biological Chemistry, 287, 28152-28162, 2012. (Veja aqui)

 

13. Vieira, Tuane C. R. G.; Reynaldo, Daniel P.; Gomes, Mariana P. B.; Almeida, Marcius S.; Cordeiro, Yraima; Silva, Jerson L. Heparin Binding by Murine Recombinant Prion Protein Leads to Transient Aggregation and Formation of RNA-Resistant Species. Journal of the American Chemical Society, 133, 334-344, 2011. (Veja aqui)

 

14. Silva, Jerson L.; Vieira, Tuane C.R.G.; Gomes, Mariana P.B.; Rangel, Luciana P.; Scapin, Sandra M.N.; Cordeiro, Yraima. Experimental approaches to the interaction of the prion protein with nucleic acids and glycosaminoglycans: Modulators of the pathogenic conversion. Methods, 53, 306-317, 2011. (Veja aqui)

 

15. Silva, Jerson, L.; Vieira, T. C. R. G.; Gomes, M. P. B.; Cordeiro, Y. PrP interactions with nucleic acids and glycosaminoglycans in function and disease. Frontiers in Bioscience, 15, 132-150, 2010. (Veja aqui)

 

16. Silva, Jerson L.; Vieira, Tuane C. R. G.; Gomes, Mariana P. B.; Bom, Ana Paula Ano; Lima, Luis Mauricio T. R.; Freitas, Monica S.; Ishimaru, Daniella; Cordeiro, Yraima; Foguel, Debora. Ligand Binding and Hydration in Protein Misfolding: Insights from Studies of Prion and p53 Tumor Suppressor Proteins. Accounts of Chemical Research, 43, 271-279, 2010. (Veja aqui)

 

17. Ano Bom, A. P. D.; Freitas, M. S.; Moreira, F. S.; Ferraz, D.; Sanches, D.; Gomes, A. M. O.; Valente, A. P.; CORDEIRO, Y.; Silva, J. L. The p53 Core Domain Is a Molten Globule at Low pH: FUNCTIONAL IMPLICATIONS OF A PARTIALLY UNFOLDED STRUCTURE. The Journal of Biological Chemistry, 285, 2857-2866, 2010. (Veja aqui)

18. Macedo, Bruno; Kaschula, Catherine H.; Hunter, Roger; Chaves, Juliana A.P.; van der Merwe, Johannes D.; Silva, Jerson L.; Egan, Timothy J.; Cordeiro, Yraima. Synthesis and anti-prion activity evaluation of aminoquinoline analogues. European Journal of Medicinal Chemistry, v45, 5468-5473, 2010. (Veja aqui)

 

19. Marques, Adriana F.; Cordeiro, Yraima; Silva, Jerson L.; Lima, Luis Mauricio T.R. Enhanced prion protein stability coupled to DNA recognition and milieu acidification. Biophysical Chemistry, 141, 135-139, 2009. (Veja aqui)

 

20. ISHIMARU, D.; Ano Bom A. P. D; Lima, L. M. T. R.; QUESADO, P. A.; Oyama, M. F. C.; GALLO, C. V. M.; CORDEIRO, Y.; Silva, J. L. Cognate DNA Stabilizes the Tumor Suppressor p53 and Prevents Misfolding and Aggregation. Biochemistry, 48, 6126-6135, 2009. (Veja aqui)

 

21. ROMANO, S. A.; Cordeiro, Y.; Lima, L. M. T. R.; LOPES, M. H.; Silva, J. L.; Foguel, D.; Linden, R. Reciprocal remodeling upon binding of the prion protein to its signaling partner hop/STI1. The FASEB Journal, 23, 4308-4316, 2009. (Veja aqui)

 

22. Silva, J. L.; Lima, L. M. T. R.; Foguel, D.; CORDEIRO, Y. The intriguing nucleic acid-binding features of the mammalian prion protein. Trends in Biochemical Sciences, 33, 132-140, 2008. (Veja aqui)

 

23. Gomes, M. P. B.; MILLEN, T. A.; Ferreira P. S.; CUNHA-E-SILVA, N. L.; Vieira, T. C. R. G.; Almeida, M. S.; Silva, J. L.; CORDEIRO, Y. Prion protein complexed to N2a cellular RNAs through its N-terminal domain forms aggregates and is toxic to murine neuroblastoma cells. The Journal of Biological Chemistry, 283, 19616-19625, 2008. (Veja aqui)

 

24. Gomes, Mariana P. B.; Cordeiro, Yraima; Silva, Jerson L. The peculiar interaction between mammalian prion protein and RNA. PRION, 2, 64-66, 2008. (Veja aqui)

 

25. Silva, J. L.; CORDEIRO, Y.; Foguel, D. Protein Folding and Aggregation: Two sides of the same coin in the condensation of proteins revealed by pressure studies. BBA. Proteins and Proteomics, 1764, 443-451, 2006. (Veja aqui)

 

26. CORDEIRO, Y.; KRAINEVA, J.; SUAREZ, M. C.; TEMPESTA, A. G.; KELLY, J. W.; Silva, J. L.; WINTER, R.; Foguel, D. FT-IR spectroscopy provides a fingerprint for the tetramer and for the aggregates of transthyretin. Biophysical Journal, 91, 957-967, 2006. (Veja aqui)

 

27. Lima, L. M. T. R.; CORDEIRO, Y.; Tinoco, L. W.; MARQUES, A. F.; Oliveira, C. L. P.; SAMPATH, S.; Foguel, D.; Torriani, I.; CAUGHEY, B.; Silva, J. L. Structural insights into the interaction between prion protein and nucleic acid. Biochemistry, 45, 9180-9187, 2006. (Veja aqui)

 

28. CORDEIRO, Y.; Silva, J. L. The Hypothesis of the Catalytic Action of Nucleic Acid on the Conversion of Prion Protein. Protein and Peptide Letters, 12, 251-255, 2005. (Veja aqui)

 

29. Cordeiro, Y.; KRAINEVA, J.; WINTER, R.; Silva, J.L. Volume and energy folding landscape of prion protein revealed by pressure. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, 38, 1195-1201, 2005. (Veja aqui)

 

30. CORDEIRO, Y.; KRAINEVA, J.; Gomes, M. P. B.; LOPES, M. H.; Martins, V. R.; Lima, L. M. T. R.; Foguel, D.; WINTER, R.; Silva, J. L. The amino-terminal PrP domain is crucial to modulate prion misfolding and aggregation. Biophysical Journal, 89, 2667-2676, 2005. (Veja aqui)

 

31. CORDEIRO, Y.; KRAINEVA, J.; RAVINDRA, R.; Lima, L. M. T. R.; Gomes, M. P. B.; Foguel, D.; WINTER, R.; Silva, J. L. Hydration and packing effects on prion folding and beta-sheet conversion: High-pressure spectroscopy and pressure perturbation calorimetry studies. The Journal of Biological Chemistry, 279, 32354-32359, 2004. (Veja aqui)

 

32. ISHIMARU, D.; ANDRADE, L. R.; TEIXEIRA, L. S. P.; QUESADO, P. A.; MAIOLINO, L. M.; LOPEZ, P. M.; CORDEIRO, Y.; COSTA, L. T.; Heckl, W. M.; WEISSMUELLER, G. Fibrillar aggregates of the tumor suppressor p53 core domain. Biochemistry, 42, 9022-9027, 2003. (Veja aqui)

 

33. Cordeiro, Y.; Lima, L. M. T. R.; Gomes, M. P. B.; Foguel, D.; Silva, J. L. Modulation of Prion Protein Oligomerization, Aggregation, and -sheet Conversion by 4,4'-Dianilino-1,1'-binaphthyl-5,5'-sulfonate (bis-ANS). Journal of Biological Chemistry, 279, 5346-5352, 2004. (Veja aqui)

 

34. Cordeiro, Y.; Machado, F.; Juliano, L.; Juliano, M. A.; Brentani, R. R.; Foguel, D.; Silva, J. L. DNA Converts Cellular Prion Protein into the beta-Sheet Conformation and Inhibits Prion Peptide Aggregation. The Journal of Biological Chemistry, 276, 49400-49409, 2001. (Veja aqui)

CONTATO

Faculdade de Farmácia, UFRJ

CCS, Bloco B, subsolo, sala 17

Ilha do Fundão, Rio de Janeiro

RJ • 21941-902 • Brasil

Tel: +55 (21) 2260-9192 | Ramal 210

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